DNA Sequences Fractal-Like Structures Repeated Fragments Palindrome Complementary Palindrome Computer Applications Life and Medical Sciences Biology and Genetics Pattern Recognition
Issue Date:
2009
Publisher:
Institute of Information Theories and Applications FOI ITHEA
Abstract:
Разработан и реализован алгоритм выявления фракталоподобных структур в ДНК-
последовательностях. Фрактальность трактуется как самоподобие, основанное на свойстве
симметрии или комплементарной симметрии. Локальные фракталы интересны своей способностью
аккумулировать множественные палиндромно-шпилечные структуры с потенциально возможными
регуляторными функциями. Выявлены реальные случаи проявления фрактальности в различных
геномах: от вирусов до человека. Рассмотрена возможность использования фракталоподобных
структур в качестве маркеров, различающих близкие классы последовательностей.
